В моём случае всё сводилось к sitemap и внутренней перелинковке — если не давать Яндексу чётких указаний, новые темы просто остаются невидимками. Да, Яндекс по части индексации медленнее, чем Google, но правильные настройки сильно помогают. robots.txt и модерация тоже играют роль, но без хорошей карты сайта и ссылок толку мало.